Neji ist ein ruhiger und besonnener Mensch, der sich eher im Hintergrund hält und nur dann etwas sagt, wenn es notwendig ist. Er glaubt an Fakten und Beweise und steht allen Dingen eher skeptisch gegenüber, die er auch stets zu analysieren versucht.Allerdings ist er auch fest von der Determination des menschlichen Schicksals überzeugt. Er hat ein gespaltenes Verhältnis zu seinem eigenen Clan: Er liebt natürlich seinen Vater, aber er kann es der Hauptfamilie nicht verzeihen, dass dieser wegen ihnen sterben musste. Dieser Hass prägt seinen Lebensweg und so wächst er zu einem der stärksten Ninja aus dem Hyūga-Clan heran, denn er will beweisen, dass die Nebenfamilie nicht weniger Wert hat. Aufgrund dieser Verhältnisse verabscheut er auch seine Cousine Hinata, da sie für ihn den Tod seines Vaters verkörpert und er bringt sie während der Chūnin-Auswahlprüfung fast um, als sie ihn provoziert. Besonders schlimm war für ihn, dass sein Vater ihm kurz vor seinem Tod noch auftrug, die Hauptfamilie, besonders Hinata, zu beschützen.
Erst nach seiner Niederlage gegen Naruto Uzumaki bei erwähnter Prüfung, erfährt er von Hiashi Hyūga, dass sein Vater aus freiem Willen starb und das Oberhaupt des Clans entschuldigt sich offiziell bei ihm, was seinen Groll beendet und durch die Niederlage selbst fängt er langsam an wie Naruto zu glauben, dass man durch Willenskraft schier unmögliche Hürden überwinden kann