Tobi ist derjenige, der Sasuke auflauert. Als dieser ihn aber als einen von Akatsuki erkennt (anhand von Tobis Kleidung), rennt Tobi hinter einen Baum und sagt: "Du machst mir Angst...", wobei Sasuke abgelenkt ist und hinterrücks von Deidara attackiert wird. Tobi weint während des Kampfes für kurze Zeit, da er Deidara für tot hält, hört aber wieder auf, als Deidara wieder aufsteht. Tobi scheint jedoch später nicht traurig, als Deidara wirklich stirbt. Im Laufe des Kampfes wird Tobi von Sasuke mit dem Chidori-Schwert angegriffen und geht zu Boden. Sasuke, der behauptet: "Einer ist erledigt...", dreht sich dann entsetzt um, als Tobi nach einer Weile wieder aufsteht und ironisch behauptet: "Oho, dieses Shunshin no Jutsu ist ja viiiel zu schnell für uns Deidara!". Nachdem Tobi das Erdversteck-Jutsu angewandt hat, um eine Technik von Deidara vorzubereiten, verschwindet er vom Feld, da Deidara ihn mit seiner nächsten Technik umbringen würde, würde er in deren Radius bleiben.
Nach dieser Explosion wird er von allen Akatsuki außer Pain, Konan und Zetsu für tot gehalten.